本案刑事诉讼程序中有以下一些不当之处：
1．人民法院不接受报案是错误的。依据法律规定，人民法院对于报案，无论是否属于自己管辖，都应当接受。
2．由李某被限制人身自由并被剥夺政治权利的哥哥作保证人取保候审不符合法律规定。李某的哥哥不符合法律规定的保证人的条件。
3．在李某企图自杀的情形下，人民检察院不批准逮捕有悖于法律规定。法律规定此种情况下应当批准逮捕。
4．人民检察院对于经过两次补充侦查仍然证据不足的案件提起公诉，是违反法律规定的。对于经过两次补充侦查的案件，检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应作出不起诉决定。
5．李某的哥哥申请证人出庭作证，法庭宣布中止审理是错误的。这符合延期审理的规定，应决定延期审理。
6．由李某的哥哥担任辩护人是不符合法律规定的。法律禁止正在被执行刑罚或依法被剥夺、限制人身自由的人担任辩护人。李某的哥哥被判处管制并被剥夺政治权利，所以不能担任辩护人。
7．人民法院作出无罪判决是错误的，应作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。此两种无罪判决是有区别的。
8．人民法院认为没有上诉、抗诉的一审判决为终审判决，因而驳回人民检察院的起诉是错误的。对于人民法院作出的证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决，人民检察院掌握了新证据后再次提起公诉，人民法院应当受理。
